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動力學(xué)分析為何離不開分子互作儀?
一、動力學(xué)分析的核心需求 :捕捉動態(tài)相互作用
動力學(xué)分析的本質(zhì)是研究分子、細(xì)胞或系統(tǒng)在時間維度上的行為變化,例如藥物與靶標(biāo)蛋 白的結(jié)合速率、蛋白質(zhì)折疊路徑、病毒與宿主受體的識別過程等。這類研究需要實(shí)時監(jiān)測 分子間相互作用的動態(tài)參數(shù),如結(jié)合常數(shù)(Kd)、解離速率(koff)、結(jié)合速率(kon)
等,而這些參數(shù)直接決定了生物過程的效率與機(jī)制。
傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)方法(如熒光標(biāo)記、放射性同位素法)存在標(biāo)記干擾、耗時長、通量低等缺陷, 難以滿足復(fù)雜動態(tài)系統(tǒng)的分析需求。而分子互作儀通過無標(biāo)記、實(shí)時監(jiān)測的技術(shù)特性,成 為動力學(xué)分析的“核心工具”。例如,在藥物研發(fā)中,通過分子互作儀可精準(zhǔn)量化抑制劑與 酶的結(jié)合動力學(xué),預(yù)測藥物在體內(nèi)的代謝半衰期。
二、Gator Pro BLI儀器的技術(shù)革新
Gator Pro是由小鱷生物( Gator Bio)開發(fā)的高通量生物層干涉技術(shù)(BioLayer Interferometry, BLI )儀器,其技術(shù)優(yōu)勢與動力學(xué)分析需求高度契合:
1. 無標(biāo)記實(shí)時監(jiān)測
BLI技術(shù)通過檢測生物分子結(jié)合時引起的微米級懸臂梁光學(xué)干涉信號變化,無需熒光 標(biāo)記或放射性同位素,避免了標(biāo)記物對分子天然構(gòu)象的干擾。例如,在研究抗體-抗 原結(jié)合時,Gator Pro可直接監(jiān)測完整抗體(含F(xiàn)c段)與抗原的結(jié)合過程,而無需截 短或標(biāo)記。
2. 高通量與自動化
Gator Pro支持96孔板高通量檢測,單次實(shí)驗(yàn)可完成數(shù)百個樣本的動態(tài)分析,實(shí)驗(yàn)效 率較傳統(tǒng)SPR技術(shù)提升5倍以上。其自動化的樣品加載與清洗系統(tǒng),尤其適用于篩選 小分子化合物庫(如藥物先導(dǎo)物庫)的親和力與動力學(xué)參數(shù)。
3. 寬動態(tài)范圍與高靈敏度
該儀器可檢測低至納摩爾級(nM )的結(jié)合親和力,并能區(qū)分微秒級( μs)的結(jié)合時 間差異。例如,在酶抑制動力學(xué)研究中,Gator Pro可捕捉抑制劑與靶酶從快速結(jié)合 (kon=1e6 M-1s-1)到緩慢解離(koff=1e-4 s-1)的全過程。
三、GatorPro在動力學(xué)分析中的典型應(yīng)用
1. 藥物發(fā)現(xiàn):從靶標(biāo)驗(yàn)證到優(yōu)化
在新冠疫情期間,Gator Pro被用于篩選ACE2受體與病毒刺突蛋白的結(jié)合抑制劑。 通過動態(tài)分析藥物候選物的kon/koff值,科研團(tuán)隊(duì)快速篩選出高選擇性化合物,縮短 了3個月的實(shí)驗(yàn)周期。此外,該儀器還可評估藥物分子對靶標(biāo)蛋白構(gòu)象的誘導(dǎo)效應(yīng), 指導(dǎo)結(jié)構(gòu)優(yōu)化。
2. 蛋白工程:揭示折疊與變構(gòu)機(jī)制
研究團(tuán)隊(duì)利用Gator Pro分析溶菌酶變構(gòu)位點(diǎn)的動態(tài)特性,發(fā)現(xiàn)特定小分子可誘導(dǎo)酶構(gòu)象變化,從而增強(qiáng)催化活性。此類數(shù)據(jù)為設(shè)計工程酶(如工業(yè)催化劑)提供了關(guān) 鍵動力學(xué)參數(shù)。
3. 免疫療法:評估免疫檢查點(diǎn)抑制劑
在PD-1/PD-L1抑制劑開發(fā)中,Gator Pro可量化腫瘤細(xì)胞表面PD-L1與T細(xì)胞受體的 結(jié)合動力學(xué)。實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)顯示,高親和力抑制劑(Kd<1nM)可顯著延長結(jié)合時間
(t1/2>24小時),從而增強(qiáng)抗腫瘤效果。
四、技術(shù)對比 : BLI vs. SPR vs. MST
技術(shù) 類型 |
核心 原理 |
動力學(xué)分析能力 |
適用場景 |
BLI |
懸臂 梁光 學(xué)干 涉 |
實(shí)時監(jiān)測結(jié)合/解離全 過程,支持納秒級時間 分辨率 |
大分子復(fù)合物、 膜蛋白、細(xì)胞表 面相互作用 |
SPR |
表面 等離 子共 振 |
依賴表面固定化,難以 區(qū)分結(jié)合與擴(kuò)散效應(yīng) |
固定化分子(如 芯片表面蛋白) 的靜態(tài)親和力 |
MST |
微量 熱泳 動 |
通過熱變性曲線間接推 算結(jié)合參數(shù),無法直接 獲取kon/koff |
熱力學(xué)穩(wěn)定性分 析、大分子復(fù)合 物解離能計算 |
案例對比 :在EGFR抑制劑篩選中,SPR需固定化靶酶,可能破壞天然構(gòu)象;而Gator Pro 可直接使用溶液態(tài)酶,獲得更接近生理?xiàng)l件的kon值(如1e5 M-1s-1 vs. 1e4 M-1s-1),指 導(dǎo)藥物優(yōu)化。
五、未來趨勢 :智能化與多技術(shù)融合
Gator Pro 2.0版本已集成AI算法,可自動識別結(jié)合事件并生成動力學(xué)模型。例如,通過機(jī) 器學(xué)習(xí)預(yù)測化合物對靶標(biāo)蛋白的構(gòu)象鎖定效應(yīng),將實(shí)驗(yàn)周期從數(shù)周縮短至48小時。此外, 該儀器正與單細(xì)胞測序平臺聯(lián)用,研究腫瘤微環(huán)境中免疫細(xì)胞與腫瘤細(xì)胞的動態(tài)互作網(wǎng)
絡(luò)。
分子互作儀通過提供“動態(tài)視角”的分子相互作用數(shù)據(jù),已成為現(xiàn)代動力學(xué)分析不可或缺的 工具。Gator Pro BLI儀器憑借其無標(biāo)記、高通量、高靈敏度的技術(shù)特性,在藥物研發(fā)、蛋白工程等領(lǐng)域展現(xiàn)出其價值。隨著人工智能與多組學(xué)技術(shù)的融合,分子互作儀將進(jìn)一 步推動從“靜態(tài)結(jié)構(gòu)解析”到“動態(tài)過程調(diào)控”的研究范式轉(zhuǎn)變,為生命科學(xué)突破提供核心工 具支撐。
蘇州阿爾法生物實(shí)驗(yàn)器材有限公司成立于2008年,位于蘇州園區(qū)生物納米園(Biobay)A5幢301室。公司管理團(tuán)隊(duì)專注于科學(xué)儀器行業(yè)十四年,擁有專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì)與完善的售后服務(wù)體系,目前已為300余家實(shí)驗(yàn)室提供優(yōu)質(zhì)產(chǎn)品和服務(wù),涵蓋各大高校、檢測中心、科研機(jī)構(gòu)、制藥企業(yè)等13個群體。提供的實(shí)驗(yàn)室儀器主要包括振蕩培養(yǎng)箱,恒溫恒濕培養(yǎng)箱、二氧化碳培養(yǎng)箱、生化培養(yǎng)箱、霉菌培養(yǎng)箱、PCR儀,瑞寧移液器,生物反應(yīng)器,發(fā)酵罐,超低溫冰箱,液氮罐,高壓滅菌器,超純水機(jī),天平,離心機(jī),離心濃縮儀、研磨機(jī)、葡萄糖乳酸分析儀等。廠商企業(yè)授權(quán)包括知楚儀器、朗基、中科美菱,梅特勒,樂楓,搏旅、NEST、天根、奧盛在內(nèi)的80個余廠家。
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